Rabu, 21 November 2012


TRANSKRIPSI DNA
            DNA tidak langsung membentuk protein tetapi terlebih dahulu dibentuk RNA melaui proses yang disebut transkripsi.  Dalam pembentukan RNA tidak diawali dengan pembentukan primer seperti pada replikasi. Proses tersebut dilakukan oleh ensim RNA polymerase dengan DNA (gen) sebagai cetakan.Pada prokariot ensim RNA polymerase yang membuat polimer RNA hanya 1 dan terdapat di cytoplasma sedangkan pada eukariot terdapat 3-4 RNA polymerase semuanya didalam inti, mitochondria dan kloroplast.
RNA polymerase I terdapat pada nucleolus mempunyai berat molekul 500.000 – 700.000, berperan mentranskrip  RNA ribosom, 
RNA polymerase II dan III terdapat di cairan inti (nucleoplasm).
RNA polymerase II mempunyai berat molekul 700.000 dan berperan mentranskrip mRNA.
RNA polimerase III berperan dalam mentranskrip tRNA dan 5S RNA (sub unit r RNA)
RNA polymerase IV terdapar dalam membrane mitochondria dan membentuk mitochondria ribosom.
Tahapan transkripsi :
1.      Faktor sigma (protein) mengawali transkripsi dengan cara mengenali titik beberapa pasang basa (7-8) DNA yang disebut promotor. Kemudian melakukan pemutusan ikatan rangkap.
2.      NTP membentuk pasangan dengan rantai DNA antisense pada arah 3’ – 5’
3.      Polimerisasi dilakukan oleh ensim RNA polymerase, sertadiikuti  pemutusan 2 molekul fosfat.
4.      Terminasi pembentukan RNA dilakukan oleh factor rho.
5.      Sintesis RNA dilakukan sepanjang 1 gen.
Transkripsi prokariot (bakteri, virus) :
            Karena intinya tidak dibungkus dengan membran maka proses transkripsi langsungdilanjutkan dengan translasi. Oleh sebab itu bakteri dan virus cepat membelah.
Transkripsi eukariot (tanaman, hewan :
 Karena intinya dibungkus membarn maka RNA dibentuk sampai selesai, baru keluar dari inti menuju sitoplasma (ribosom) dan disitulah dilakukan translasi.
Perkembangbiakan prokariot > cepat dibanding eukariot.

TRANSLASI
Adalah proses penerjemahan m RNA untuk membentuk suatu polipeptida (protein) yaitu polimer dari 20 asamamino. Setiap asam amino mempunyai 3 kode , terutama 2 kode terakhir.
Kode tidak bersifat universal tetapi luas dipakai karena tidak semua organism memiliki kode sama terutama untuk inisiasi dan stop.
Tempat terjadi di ribosom.
Translasi diawali pada kodon : AUG dan UGA (eukariot)
Translasi diakhiri (stop) pada kodon : AGA dan AGG
Setiap spesies memiliki banyak tRNA dan terdiri dari 20 macam dimana masing masing membawa 1 macam asam amino.
Setiap tRNA mengandung 60-95 nukleotida dengan berat molekul 18-28 kD, bentuk clover atau hair pin dimana ujung batang 5’ fosfat mempunyai 7 gugus nukleotida.
Terminal 3’OH berikatan dengan asam amino yang disebut residu.
Lekukan (loop) dikiri kanan disebut D arm, (dehydrouridine). Sebelah kiri mempunyai 3-4 pasang basa N dan disebelah kanan mempunyai 5 pasang basa nitrogen.
Lekukan di ujung mengandung antikodon atau disebut antikodon arm.     Pengenalan antikodon terhadap kodon m RNA dilakukan oleh senyawa aminoacyl tRNA Syntase di arm.
Jumlah asam amino ada 20 macam, tetapi dikode oleh 64 trio  basa nitrogen dan yang berperan adalah basa ke 2 dan ke 3.







Ujung 5’ PO4
U
C
A
G
Ujung 3’OH
U
Phe
Phe
Leu
Leu
Ser
Ser
Ser
Ser
Tyr
Tyr
Stop
Stop
Cys
Cys
Stop
Trp
U
C
A
G
C
Leu
Leu
Leu
Leu
Pro
Pro
Pro
Pro
His
His
Gln
Gln
Arg
Arg
Arg
Arg
U
C
A
G
A
I.Leu
I Leu
I Leu
Met
Thr
Thr
Thr
Thr
Asn
Asn
Lys
Lys
Ser
Ser
Arg
Arg
U
C
A
G
G
Val
Val
Val
Val
Ala
Ala
Ala
Ala
Asp
Asp
Gln
Gln
Gly
Gly
Gly
Gly
U
C
A
G




Tidak ada komentar:

Posting Komentar